Lieber Andreas,
du hast recht mit deiner Vorsicht. Mache unbedingt alle geplanten backups, ehe du experimentierst.
Wenn du eine Mediathek zur Systemfotosmediathek machst und dann iCloud Fotos aktivierst, werden keine Bilder aus iCloud gelöscht. Aber du riskierst eventuell, Duplikate zu bekommen oder unnötige, überzählige Alben. Wenn Fotos eine Mediathek neu mit iCloud Fotos synchronisiert, werden alle Bilder in die iCloud hochgeladen und mit den dort vorhandenen Bildern verglichen. Wenn Duplikate festgestellt werden, wird nur eins der beiden Bilder behalten. iCloud versucht Konflikte zwischen Duplikaten zu lösen, wenn diese in verschiedeneren Alben sind oder unterschiedliche Metadaten haben. Es kann dennoch zu Duplikaten oder überzähligen Alben zu kommen.
Wenn ich einen neuen Mac eingerichtet habe, habe ich gar nicht erst die alte Fotosmediathek auf den neuen übertragen, sondern dort eine neue, leere Fotosmediathek im Ordner Bilder angelegt. Diese Mediathek wurde dann zur Systemfotosmediathek und hat die bestehende Mediathek aus der iCloud heruntergeladen. Das hat den Vorteil, dass das aufwendige Hochladen und vergleichen mit der bestehenden iCloud Fotosmediathek vermieden worden ist. Allerdings fehlen dann die Projekte, wie Diaschauen und Fotobücher. Dafür wird eine Sicherheitskopie der alten Mediathek benötigt. Auch einige benannte Gesichter fehlen meistens.